Oliver Rafaj pôsobí ako odborný asistent na katedre Verejnej správy a regionálneho rozvoja, Národohospodárskej fakulty, Ekonomickej univerzity v Bratislave. V rámci svojho výskumného zamerania sa venuje vzťahom ľudského kapitálu a ekonomického rozvoja na regionálnej a lokálnej úrovni. Na katedre pôsobí od roku 2015. Prednáša predmety zamerané na regionálnu ekonómiu a politiku a mestský manažment.
Od roku 2016 je členom Spoločnosti pre regionálnu vedu a politiku – Slovenskú sekciu ERSA (European Regional Science Association), kde medzi rokmi 2019-2022 pôsobil ako sekretár. Od 2023 pôsobí ako Ambasádor Regional Studies Association (RSA) pre Slovensko. V rokoch 2019-2024 pôsobil v projekte COST CA18214 „The Geography of New Working Spaces and the Impact on the Periphery“ ako Member Committe za Slovensko. V rokoch 2022-2024 bol členom užšieho vedenia tohto projektu (Core Group) na pozícii Manager for horizontal activities. Zatiaľ publikoval 8 článkov v časopisoch indexovaných databázami WOS a SCOPUS. Od začiatku svojho pôsobenia na Katedre verejnej správy a regionálneho rozvoja bol spoluriešiteľom 2 zahraničných vedeckých projektov a 9 domácich vedeckých projektov. Od roku 2013 taktiež spolupracoval na 16 projektoch pre odbornú prax v oblasti regionálneho a lokálneho ekonomického rozvoja.
